Zuletzt war er bei der Beisheim Stiftung als Projektleiter Sport tätig. Parallel dazu hat er an der Fakultät für Sport- und Gesundheitswissenschaften der Technischen Universität München promoviert und dabei untersucht, wie sich körperliche Aktivität auf das Wachstum von Krebszellen bei Kindern auswirkt.
In seiner Freizeit ist Peter Weeber gerne sportlich aktiv und erholt sich gemeinsam mit seiner Familie beim Wandern in seiner Heimat am Bodensee.